Аркнайтс: Прелюдия к рассвету

В аниме действие разворачивается в вымышленном мире под названием Терра, который схож с Землей, но его обитатели обладают особыми чертами животных и магическими способностями, известными как Искусство Оригиниума. Особенностью Терры также являются регулярные Катастрофы, которые вынуждают население мигрировать, избегая гибели. Эти же Катастрофы способствовали возникновению смертельного заболевания, Орипатию, от которого заражённые умирали во всех случаях, и которое характеризовалось высокой заразностью.

Заражённые по этой причине были изгнаны из общества, чтобы предотвратить распространение болезни. В центре сюжета находится персонаж, известный как Доктор, страдающий амнезией и не помнящий своё прошлое. Несмотря на потерю памяти, он руководит организацией «Остров Родос», специализирующейся на фармакологии и медицине. Его команда не только занимается лечением инфицированных, но и ведёт борьбу с группой заражённых, желающих мстить правительству за преследование и изгнание из-за болезни Орипатия.