Во втором сезоне действие разворачивается в ближайшем будущем, наступило время, когда самые мрачные предсказания и страхи ожили. Прогресс в области технологий сделал шаг вперед, однако ресурсов оказалось слишком мало для того, чтобы противостоять агрессорам. Земля подверглась нападению пришельцев, что привело к рабству и массовому истреблению населения — около 90% людей было уничтожено. В результате атак были образованы бункеры для тех, кто выжил. Наблюдатели жестко контролируют каждое их движение и стерли все воспоминания о жизни до инвазии.
Человеческая способность адаптироваться не знает границ, а внутренняя потребность испытывать и выражать эмоции остается неизменной даже в таких условиях. Для управления уникальными механизмами выбраны трое подростков, которые объединяются для создания робота по имени Мусаси, сделанного из экзотического сплава «мегатроний». Они еще не знают, что вскоре им предстоит столкнуться с смертельными опасностями. Членам сопротивления предстоит преодолеть множество препятствий и выполнить критически важную миссию: сохранить накопленные знания и воспоминания для будущих поколений, чтобы они могли чувствовать и создавать.