История аниме берет своё начало 11 лет назад, когда маленький Таро Комори и его сестра стали жертвами похищения. Таро потерял сестру и был потрясён, когда при первой же попытке охоты на призраков, встретил ее в мире духов. Этот момент стал для него судьбоносным, и он решил стать охотником на призраков, чтобы спасти её и других людей, застрявших в призрачном мире. Теперь, повзрослевший Таро работает с командой охотников, включая свою девушку, которая тоже потеряла брата в сущности призрачного мира. Они используют свои способности и знания для исследования мира духов и борьбы с угрозами, которые могут вторгнуться в мир живых.
В ходе одной из миссий команда охотников сталкивается с новой и мощной угрозой – таинственным и безжалостным призраком, способным управлять другими духами и контролировать сознание людей. Команда Таро оказывается на грани поражения. В это же время, Таро начинает подозревать, что его сестра изменилась и возможна связана с загадочным призраком. Таро и его команда должны бросить все силы, чтобы защитить мир живых от новой опасности и раскрыть тайну прошлого Таро и его сестры. В конечном итоге они выясняют, что за этими событиями кроется значительно большая и опасная заговор, вынуждающий их бороться с новыми угрозами, способными изменить ход истории мира.